¿Cómo prepararse para una fiscalización del SII?

En los últimos años, el SII ha fortalecido sus sistemas de cruces electrónicos, lo que le permite detectar de manera rápida inconsistencias en declaraciones, facturación o devoluciones de impuestos.

Por eso, incluso si tu negocio cumple con la normativa, es posible que en algún momento recibas un requerimiento de información.

Estar preparado marca la diferencia: contar con registros contables al día, respaldos organizados y conciliaciones claras te permitirá responder sin contratiempos y reducir el riesgo de observaciones mayores.

En este artículo revisaremos qué suele fiscalizar el SII, qué documentos son clave tener listos y qué buenas prácticas pueden ayudarte a enfrentar este proceso con seguridad y eficiencia.

¿Por qué preocupa tanto una fiscalización del SII?

Cuando alguien escucha “fiscalización del SII”, lo primero que viene a la mente es “riesgo”, “multas”, “problemas”. En muchos casos, la fiscalización es simplemente una revisión de cumplimiento tributario (no necesariamente de fraude).

Pero sí, puede implicar consecuencias si hay errores o inconsistencias. Por ello, prepararte anticipadamente da una enorme ventaja: reduces la ansiedad, disminuyes el riesgo de sanciones mayores y mejoras tu relación con el fisco.

Según la Cuenta Pública 2025 del SII, en ese año el Servicio “observó” las declaraciones de 532.766 contribuyentes (una ligera caída de 1,2 % respecto del período anterior).

Esa cifra de “observados” no significa todos sancionados, sino que hubo algún tipo de revisión o requerimiento. Es una señal de que no estás “solo” si te toca.

Además, con la nueva estrategia tributaria, el SII hoy pone atención a información cruzada proveniente de las instituciones financieras, como movimientos bancarios con más de 50 transferencias dentro de ciertos plazos. Ese tipo de cruces automatizados elevan el nivel de exigencia.

Por eso, una buena preparación no solo ayuda cuando ya estás fiscalizado, sino que puede evitar que te fiscalicen con mayor profundidad.

¿Qué es exactamente una fiscalización del SII?

La fiscalización es el proceso mediante el cual el SII verifica que tus declaraciones tributarias (mensuales, anuales, declaraciones juradas) coincidan con tus documentos, registros contables y operaciones reales. 

Si quieres profundizar en el concepto y fundamentos legales de este proceso, te recomiendo leer nuestro artículo sobre la fiscalización en materia tributaria.

Tipos de fiscalización según su alcance

No todas las fiscalizaciones son iguales: hay diferentes tipos y niveles de alcance.

• Masivas / automatizadas: Se ejecutan a gran escala (por ejemplo, Operación IVA u Operación Renta). En estas, el SII hace cruces lógicos, verificaciones matemáticas y cruces con bases de datos. En la Operación IVA, el SII procesa más de un millón de declaraciones mensuales y selecciona un porcentaje (aproximadamente 10 %) para citación por discrepancias.
• Selectivas / auditorías profundas: Cuando se detectan riesgos más altos, como por ejemplo, grandes empresas, operaciones inusuales, diferencia patrimonial considerable, precios de transferencia, el SII puede tomar un enfoque más exhaustivo.
• Fiscalización electrónica: La Ley contempla que el SII acceda a tus registros digitales, sistemas contables o bases de datos, excluyendo lo que esté protegido por secreto comercial o empresarial.
• Fiscalización en terreno / presencia fiscalizadora: inspectores visitan tu negocio, revisan documentos, verifican emisión de boletas/facturas, entre otros.

Una combinación de estos modos puede aparecer en un mismo proceso.

¿Cuándo y cómo el SII puede iniciar una fiscalización?

Aquí están los factores más comunes:

1. Cruces de datos e inconsistencias
   Si tus declaraciones no cuadran con la información que el SII recibe de terceros (bancos, proveedores, instituciones financieras), podrías ser seleccionado para revisión.
2. Operaciones financieras inusuales
   Por ejemplo, recibir más de 50 transferencias desde distintas personas en un período determinado puede activar alertas automatizadas.
3. Sector de actividad / historial de incumplimientos
   Si tu negocio opera en sectores con mayores riesgos fiscales (servicios profesionales, comercio electrónico, importaciones), o si has tenido observaciones anteriores.
4. Participación en planes de cumplimiento del SII
   Algunos contribuyentes quedan dentro de programas especiales de monitoreo, como el Plan de Cumplimiento Tributario 2025 del SII, que define sectores y prácticas con mayor riesgo de fiscalización.
5. Requerimientos del SII o denuncias
   Ante indicios válidos de irregularidades, terceros pueden denunciar o el mismo SII puede iniciar procesos selectivos.

En cuanto al procedimiento:

• Notificación formal: El SII debe entregarte un requerimiento válido (por carta, cédula, expediente electrónico). El documento debe detallar qué períodos, impuestos o aspectos serán revisados, qué documentos necesitas entregar y el plazo para responder.
• Plazo para responder: típicamente 30 días, con posible prórroga por 30 días más, si justificas la extensión.
• Examen y análisis: el SII examinará tus documentos contables, balances, libros, declaraciones juradas, facturas, contratos, etc.
• Conclusión formal: pueden emitir liquidaciones, girar impuestos, multas o cerrar la fiscalización si está todo en regla.

La normativa del Código Tributario (en particular el artículo 59) señala los plazos máximos para que el SII concluya el proceso: en casos normales, hasta 9 meses; en casos especiales, hasta 12 o incluso 18 meses (y puede prorrogarse por única vez hasta 6 meses más).

Qué documentos y antecedentes te pueden pedir en una fiscalización del sii

El requerimiento específico varía según el objetivo de la fiscalización, pero algunos documentos recurrentes son:

• Estados financieros (balance, estado de resultados)
• Libros contables: diario, mayor, libro de compras y ventas
• Declaraciones mensuales de IVA (Formulario 29), DJ y declaraciones juradas (como la DJ 1887, 1879, 1948, entre otras), Formulario 22 de Renta (u otras declaraciones anuales)
• Contratos, órdenes de compra, comprobantes de venta, facturas y boletas
• Nóminas, remuneraciones, pagos previsionales
• Soportes de gastos (boletas, facturas, comprobantes)
• Documentos de respaldo de inversiones, adquisiciones de activos y su justificación patrimonial
• Información de operaciones con partes relacionadas, precios de transferencia, exportaciones / importaciones
• Registros digitales o respaldo de sistemas contables, cuando aplique
  
  Tener tus respaldos organizados es fundamental, pero igual de importante es contar con políticas internas que aseguren consistencia y trazabilidad. Aquí el compliance tributario en Chile juega un rol clave para prevenir errores y dar solidez frente a una fiscalización

Pasos prácticos para prepararte con tiempo

Aquí tienes un plan de acción:

Y un consejo: si ya usas un sistema como Nubox, aprovecha funciones que te ayudan a rastrear facturas, libros contables, cierres periódicos, conciliación bancaria automática y respaldo documental en la nube.

Estas funciones no solo te facilitan el día a día, sino que también te preparan mejor para una fiscalización: en lugar de perder horas buscando papeles o cuadrando cifras, puedes entregar información clara y consistente en pocos clics.

En un escenario donde el SII cruza cada vez más datos en tiempo real, la digitalización se convierte en tu mejor defensa.

Tener todo centralizado y respaldado te da rapidez de respuesta, minimiza errores humanos y te permite enfrentar una revisión con seguridad, mostrando orden y transparencia frente al fiscalizador.

Qué hacer cuando recibes el requerimiento de fiscalización

1. Lee bien el documento: Verifica los períodos, los impuestos sujetos a revisión y los plazos para responder.
2. Coordina con tu asesor contable / jurídico: Antes de responder, revisa junto a profesionales si tienes vulnerabilidades o si hay errores que puedas subsanar.
3. Responder dentro del plazo: Presenta la documentación solicitada ordenada, con índices, explicaciones y anexos explicativos si es necesario. Es preferible entregar de más que de menos.
4. Solicita prórroga si la necesitas: Si no puedes completar todo en 30 días por razones justificadas, pide extensión fundamentada (30 días más).
5. Mantén comunicación clara y respaldada: Si el fiscalizador te pide aclaraciones, hazlo por escrito, con respaldo y estructura lógica.
6. Solicita copia certificada del cierre: Una vez cerrado el proceso, pide al SII la resolución o certificación de que quedó terminado ese ciclo.
7. Si no estás de acuerdo: Puedes presentar reposición administrativa voluntaria (RAV) o recurrir a los Tribunales Tributarios y Aduaneros.
   También puedes acudir a la Defensoría del Contribuyente (DEDECON), creada por la Ley 21.210, que vela por tus derechos frente a posibles actos arbitrarios del SII.

Tu ventaja está en la preparación

Una fiscalización del SII no tiene por qué ser traumática si te anticipas. Tener tus procesos internos en orden, respaldo documental, asesoría confiable y sistemas digitales robustos, como los que ofrece Nubox en contabilidad, facturación y gestión tributaria, te dan una ventaja clara frente a sorpresas indeseadas.

Recuerda:

• La fiscalización busca control y cumplimiento, no necesariamente “atrapar” al contribuyente.
• No estás desprotegido: la ley establece plazos, derechos, procedimientos y recursos.
• Prepararte con antelación reduce el riesgo, la tensión y mejora tu posición en caso de discrepancias.