¿Qué es la licencia médica electrónica?

La licencia médica electrónica (LME) deja constancia digital del reposo que un profesional de salud habilitado indica a un trabajador, ya sea para ausentarse de sus labores o para cumplir una jornada reducida durante un período determinado.

Tiene la misma validez que una licencia médica en papel y cumple dos funciones:

  • Laboral: permite al trabajador ausentarse o reducir su jornada durante el período de reposo indicado.
  • Previsional: puede dar derecho al Subsidio por Incapacidad Laboral (SIL), siempre que se cumplan los requisitos correspondientes.

La diferencia está en su tramitación: en lugar de trasladar un formulario físico entre las partes, la información circula mediante un sistema electrónico.

¿Quién emite y quién aprueba una licencia médica electrónica?

La licencia puede ser emitida por un médico cirujano, cirujano dentista o matrona, dentro de sus respectivas competencias legales.

Sin embargo, que un profesional la emita no significa que esté automáticamente aprobada.

La entidad responsable de pronunciarse depende del sistema de salud del trabajador:

  • Fonasa: la Comisión de Medicina Preventiva e Invalidez (COMPIN).
  • Isapre: la institución de salud previsional correspondiente.

Estas entidades pueden autorizar, rechazar, reducir o ampliar el período de reposo, según la normativa.

También existen licencias asociadas a accidentes laborales y enfermedades profesionales, cuya tramitación considera a los organismos administradores de la Ley N.º 16.744.

Si necesitas conocer estas diferencias, revisa nuestro artículo sobre los tipos de licencia médica en Chile.

¿Cómo funciona la licencia médica electrónica paso a paso?

Cuando el empleador está incorporado al sistema de tramitación electrónica, el procedimiento habitual es el siguiente:

  • Emisión: el profesional de salud evalúa al trabajador y emite la licencia mediante una plataforma autorizada.
  • Recepción: la licencia queda disponible electrónicamente para el empleador.
  • Tramitación: la empresa completa los antecedentes laborales y previsionales que le corresponden.
  • Evaluación: la COMPIN o Isapre revisa los antecedentes y emite su pronunciamiento.
  • Resolución: se informa si la licencia fue autorizada, rechazada, reducida o ampliada.
  • Pago: si corresponde, la entidad responsable gestiona el Subsidio por Incapacidad Laboral.

Este procedimiento permite mantener un registro digital de las distintas etapas.

Importante: el empleador participa en la tramitación administrativa, pero no decide si el reposo médico está justificado.

¿Qué debe hacer el empleador al recibir una licencia médica electrónica?

Aunque la licencia llegue automáticamente, la empresa debe realizar las gestiones que le corresponden.

Principalmente:

  • Ingresar a la plataforma de tramitación electrónica.
  • Verificar los antecedentes laborales del trabajador.
  • Completar la información de remuneraciones y cotizaciones.
  • Adjuntar los documentos solicitados, cuando corresponda.
  • Enviar los antecedentes dentro del plazo legal.
  • Mantener un registro de la licencia y su resolución.

También es recomendable registrar los días de ausencia en el sistema interno de remuneraciones y control de asistencia.

Esto permite evitar diferencias entre las jornadas informadas, las remuneraciones calculadas y los períodos de reposo.

¿Cuáles son los plazos para tramitar una licencia médica electrónica?

Según la Superintendencia de Seguridad Social (SUSESO), cuando la licencia se emite para su tramitación completamente electrónica, el plazo de presentación por parte del trabajador se entiende cumplido con su emisión.

En cambio, si debe entregarse una licencia en papel o una copia impresa para tramitación, los plazos son:

  • Trabajadores del sector privado: dos días hábiles.
  • Trabajadores del sector público: tres días hábiles.

Estos plazos se cuentan conforme a las reglas aplicables desde el inicio del reposo.

¿Y cuánto tiempo tiene el empleador?

Debe completar y remitir la licencia dentro de tres días hábiles, según las reglas de recepción o puesta a disposición que correspondan.

Incumplir este plazo puede generar consecuencias económicas para la empresa.

Por eso, conviene revisar periódicamente las licencias recibidas y no depender únicamente de que el trabajador informe su ausencia.

¿Qué ocurre si la empresa no está incorporada al sistema electrónico?

En ese caso, la licencia no necesariamente llegará de forma automática al empleador.

El profesional de salud debe entregar al trabajador una copia impresa de la licencia emitida electrónicamente, para que pueda presentarla y continuar su tramitación.

La empresa deberá completar los antecedentes y remitirlos a la entidad correspondiente dentro del plazo establecido.

Por lo tanto, una licencia emitida digitalmente no siempre implica que todo el proceso posterior sea electrónico.

La SUSESO explica esta diferencia en su orientación oficial sobre licencia médica electrónica.

¿Cómo consultar el estado de una licencia médica electrónica?

El seguimiento depende del sistema de salud al que pertenezca el trabajador.

  • Si está afiliado a Fonasa, puede consultar su licencia mediante los servicios de COMPIN, utilizando ClaveÚnica o los datos requeridos para la consulta.
  • Si pertenece a una Isapre, puede revisar el estado a través de los canales habilitados por su institución.

Los principales estados son:

  • Pendiente: todavía no existe una resolución definitiva.
  • Autorizada: se aprobó el reposo indicado.
  • Rechazada: no se autorizó la licencia.
  • Reducida: se aprobó un período menor.
  • Ampliada: se autorizó un período mayor.

Puedes encontrar los canales de consulta en ChileAtiende.

Para la empresa, es importante verificar el resultado antes de cerrar los antecedentes administrativos asociados al período.

¿Qué pasa si una licencia médica electrónica es rechazada?

El rechazo significa que la entidad evaluadora no autorizó la licencia en los términos presentados.

Pero no necesariamente es una decisión definitiva.

El trabajador puede reclamar mediante los procedimientos correspondientes:

  • Si la resolución proviene de una Isapre, puede presentar una reclamación ante la COMPIN.
  • Si la resolución corresponde a la COMPIN, puede solicitar su reconsideración y, cuando proceda, recurrir ante la SUSESO.

Los plazos y antecedentes dependen del procedimiento.

La recomendación es revisar la resolución y su fecha de notificación antes de presentar el reclamo.

¿Quién paga una licencia médica electrónica?

La modalidad electrónica no cambia las reglas de financiamiento del reposo.

Cuando se cumplen los requisitos legales, el trabajador puede recibir un Subsidio por Incapacidad Laboral que reemplaza total o parcialmente sus ingresos durante el período correspondiente.

Según su afiliación y el tipo de licencia, el pago puede estar a cargo de una Isapre, una Caja de Compensación u otra entidad competente.

En determinadas situaciones, como las de trabajadores del sector público, se mantienen reglas especiales de remuneración.

Para conocer los requisitos, días cubiertos y fórmulas de cálculo, consulta nuestra guía sobre el pago de licencias médicas en Chile.

Licencias médicas electrónicas en Chile: ¿qué dicen las cifras?

La gestión de licencias médicas tiene una dimensión importante dentro del sistema de seguridad social chileno.

Según un informe de la SUSESO publicado el 21 de septiembre de 2026, entre enero y agosto se emitieron aproximadamente 4,3 millones de licencias médicas electrónicas de origen común, un 14% menos que en el mismo período de 2025.

El organismo también registró una disminución en el número de personas que utilizaron al menos una licencia y en el promedio de días autorizados por documento.

Para las empresas, estas cifras muestran la importancia de contar con procesos administrativos que permitan gestionar oportunamente los períodos de reposo.

Errores frecuentes al gestionar licencias médicas electrónicas

Que el procedimiento sea digital no elimina la posibilidad de cometer errores.

Entre los más habituales están:

  • No revisar las licencias recibidas: puede provocar incumplimientos de plazos.
  • Ingresar remuneraciones incorrectas: puede afectar la determinación del subsidio.
  • No actualizar las ausencias: genera inconsistencias en los registros de asistencia y remuneraciones.
  • Confundir emisión con aprobación: la licencia todavía debe recibir el pronunciamiento correspondiente.
  • Solicitar información médica innecesaria: el diagnóstico del trabajador es confidencial y no debe quedar disponible para el empleador.

Este último punto es especialmente importante: el sistema electrónico debe proteger los datos de salud y restringir el acceso a quienes estén legalmente autorizados.

Preguntas frecuentes sobre la licencia médica electrónica

¿El trabajador debe avisar a la empresa si tiene una licencia electrónica?

Aunque la licencia llegue mediante el sistema digital, es recomendable que informe oportunamente su ausencia para facilitar la organización del trabajo.

¿Puede el empleador rechazar una licencia médica electrónica?

El empleador no tiene facultades para aprobar o rechazar médicamente el reposo. Puede informar situaciones administrativas previstas en la normativa, pero el pronunciamiento corresponde a la entidad competente.

¿La empresa puede conocer el diagnóstico del trabajador?

No. La información sobre el diagnóstico está protegida y no debe ser revelada al empleador mediante el sistema de licencias médicas electrónicas.

¿Se puede emitir una licencia médica en papel?

Sí, pero su utilización está limitada a las situaciones excepcionales contempladas por la normativa. La emisión electrónica constituye la modalidad general.

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